1982年畢業(yè)于武漢大學水利學院治河專業(yè)，1985年和 1989年在清華大學水利工程系水力學及河流海岸動力學專業(yè)分別獲碩士和博士學位，1989至1991年在北京大學做博士后研究工作。曾在日本北海道大學土木工程系、牛津大學工程力學系作為訪問學者進行學術(shù)交流和合作研究。1992年起在北京大學任教授。

1996年獲國家杰出青年基金資助。

1989年在清華大學獲博士學位；

1989－1991年在北京大學城市與環(huán)境學系地貌學專業(yè)從事博士后研究；

1992年被北京大學聘為教授；

1995年組織創(chuàng)辦北京大學環(huán)境工程研究所；

1998~1999年在牛津大學做訪問學者，2002年組建環(huán)境工程系。

1992年獲錢寧泥沙科學獎；

1994年獲首屆中國博士后十佳（國氏獎）、中國青年科技獎；

1995年和1997年獲國家教委科技進步獎（甲類）；

1999年獲國家教委科技進步獎（乙類）。

要從事兩相流基本理論及其在動力地貌學和環(huán)境科學與工程中的應用研究。重點研究高含沙固液兩相流和風沙運動機理主。在固液兩相流方面，從動力理論的顆粒微觀運動分析入手，提出了高濃度固液兩相流運動的描述方法，找到了高濃度和低濃度兩種情形下顆粒速度分布函數(shù)之間的關(guān)系，理論模型能夠同時描述低濃度和高濃度固液兩相流運動，克服了傳統(tǒng)方法的缺陷。在風沙兩相流方面：獲得了國內(nèi)外最系統(tǒng)和全面的一整套風洞實測資料；提出了能同時反映躍移層內(nèi)、外挾沙氣流流速特性的風速廓線確定方法，獲得了能充分反映粒徑影響的風速分布和輸沙率公式，揭示了風洞尺度變化及邊壁對風沙運動的影響。提出了流域水土流失快速評估方法、河流系統(tǒng)健康評估方法和基于生態(tài)環(huán)境保護等多目標和多約束條件的填海工程綜合優(yōu)化方法，在實際中得到了應用。曾經(jīng)主持國家自然科學基金重大項目、歐盟科技合作項目（INCO-DC）、中國-加拿大合作項目（CIDA）等20余項項目。獲部級科技進步二等獎兩項以及多項其它科技獎勵。發(fā)表論文被SCI收錄20余篇，EI收錄40余篇，出版專著2部。曾獲得中國青年科技獎、首屆中國博士后十佳等榮譽。

倪晉仁還擔任全國政協(xié)委員、全國人口資源環(huán)境委員會委員、特邀國家土地監(jiān)察專員、國際水沙科學協(xié)會（IASWS）常務(wù)理事、國際水力學會《International Journal of River Basin Management》編委、《科學通報》特邀編輯、加拿大Regina大學兼職教授、《應用基礎(chǔ)與工程科學學報》編委會主任、中國自然資源學會理事等。已出版專著3部、譯著1部，發(fā)表學術(shù)論文100余篇（SCI收錄50余篇，EI收錄50余篇），獲國家發(fā)明專利3項。獲2項國家教委科技進步獎二等獎，還曾獲首屆全國十佳博士后獎、中國青年科技獎、錢寧泥沙科學個人獎等，入選國家“百千萬人才工程”。指導50余名研究生獲博士、碩士學位。

1、Maosheng Zheng; Yuhao Tian; Tang Liu; Tao Ma; Li Li; Can Li; Muhammad Ahmad; Qian Chen; Jinren Ni*,Minimization of nitrous oxide emission in a pilot-scale oxidation ditch: Generation, spatial variation and microbial interpretation, Bioresource Technology, 179卷, pp 510-517, 2015/1.

2、*Sitong Liu; Zuotao Zhang; Jinren Ni,Behavior detection and activity recovery of damaged anammox bacteria culture after accidental overheating, Chemical Engineering Journal, 259卷, p 70-78, 2015.

3、Yin, Xiaochen; Liu, Wen;*Ni, Jinren,Removal of coexisting Cr(VI) and 4-chlorophenol through reduction and Fenton reaction in a single system, Chemical Engineering Journal, 248卷, pp 89-97, 2014/7/15.

4、Liu, Wen; Sun, Weiling; Han, Yunfei; Ahmad, Muhammad;*Ni, Jinren,Adsorption of Cu(II) and Cd(II) on titanate nanomaterials synthesized via hydrothermal method under different NaOH concentrations: Role of sodium content, Colloids and Surfaces A: Physicochemical and Engineering Aspects, 452卷, pp 138-147, 2014/6/20.

5、Liu, Wen; Zhang, Pan; Borthwick, Alistair G. L.; Chen, Hao;*Ni, Jinren,Adsorption mechanisms of thallium(I) and thallium(III) by titanate nanotubes: Ion-exchange and co-precipitation, Journal of Colloid and Interface Science, 423卷, pp 67-75, 2014/6/1.

6、Zheng, Maosheng; He, Da; Ma, Tao; Chen, Qian; Liu, Sitong; Ahmad, Muhammad; Gui, Mengyao;*Ni, Jinren,Reducing NO and N2O emission during aerobic denitrification by newly isolated Pseudomonas stutzeri PCN-1, Bioresource Technology, 162卷, pp 80-88, 2014/6.

7、Zou, Shiqiang; Yao, Shuo;*Ni, Jinren,High-efficient nitrogen removal by coupling enriched autotrophic-nitrification and aerobic-denitrification consortiums at cold temperature, Bioresource Technology, 161卷, pp 288-296, 2014/6.

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9、Pang, Lina;*Ni, Jinren; Tang, Xiaoyan,Fast characterization of soluble organic intermediates and integrity of microbial cells in the process of alkaline anaerobic fermentation of waste activated sludge, Biochemical Engineering Journal, 86卷, pp 49-56, 2014/5/15.

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11、Lei, Li;*Ni, Jinren,Three-dimensional three-phase model for simulation of hydrodynamics, oxygen mass transfer, carbon oxidation, nitrification and denitrification in an oxidation ditch, WATER RESEARCH, 53卷, pp 200-214, 2014/4/15.

12、Liu, Wen; Borthwick, Alistair G. L.; Li, Xuezhao;*Ni, Jinren,High photocatalytic and adsorptive performance of anatase-covered titanate nanotubes prepared by wet chemical reaction, Microporous and Mesoporous Materials, 186卷, pp 168-175, 2014/3/1.

13、Zhu, Yuling; Zhu, Hancan; Qiu, Muqing; Zhu, Tingting;*Ni, Jinren,Investigation on the mechanisms for biotransformation of saponins to diosgenin, World Journal of Microbiology and Biotechnology, 30(1), pp 143-152, 2014/1.

14、段明君;倪晉仁,Pseudomonas sp.QG6降解喹啉過程中除磷特性及影響因素研究, 北京大學學報(自然科學版), 02期, pp 361-368, 2014.

15、Zuotao Zhang; *Sitong Liu,Insight into the overconsumption of ammonium by anammox consortia under anaerobic conditions, Journal of Applied Microbiology, 117(6), p 1830-1838, 2014.

16、Zuotao Zhang; *Sitong Liu,Hot topics and application trends of the anammox biotechnology: a review by bibliometric analysis, Springerplus, 3卷, p 220-225, 2014.

17、馬九鵬，*倪晉仁，劉唐,潮間帶濕地底棲動物生物多樣性特征比較分析, 北京大學學報(自然科學版), 50(6), pp 1077-1086, 2014.

18、Liu, Wen; Sun, Weiling; Borthwick, Alistair G. L.;*Ni, Jinren,Comparison on aggregation and sedimentation of titanium dioxide, titanate nanotubes and titanate nanotubes-TiO2: Influence of pH, ionic strength and natural organic matter, COLLOIDS AND SURFACES A-PHYSICOCHEMICAL AND ENGINEERING ASPECTS, 434卷, pp 319-328, 2013/10/5.

19、Liu, Wen; Chen, Hao; Borthwick, Alistair G. L.; Han, Yunfei;*Ni, Jinren,Mutual promotion mechanism for adsorption of coexisting Cr(III) and Cr(VI) onto titanate nanotubes, Chemical Engineering Journal, 232卷, pp 228-236, 2013/10.

20、倪晉仁; 盧宇飛; 付東康; 吳紹祖; 吳廣安; 于亮,處理印染生化出水的絮體回流混凝工藝, 中國, 中華人民共和國國家知識產(chǎn)權(quán)局, ZL 201310428849.4.

等385條科研成果請查看科研之友。[1] 

2015年7月31日，入選中國科學院院士增選初步候選人名單。[2] 

2015年12月7日，被增選為中國科學院院士[3]  。