研究所目前擁有“環(huán)境科學與工程”和“生態(tài)學”兩個一級學科的碩士、博士學位授予點，“資源與環(huán)境”碩士專業(yè)學位授予點，以及“環(huán)境科學與工程”博士后科研流動站。 

　　一、主要任務 　　

　　1.面向國家城市化發(fā)展過程中的生態(tài)環(huán)境保護等重大戰(zhàn)略需求，面向國際城市生態(tài)科學和環(huán)境科學與技術的發(fā)展前沿，在城市生態(tài)、環(huán)境與健康，城市物質能量代謝與綠色低碳發(fā)展技術，城市環(huán)境治理與廢棄物資源化技術，城市規(guī)劃與環(huán)境政策等領域，開展理論研究、技術研發(fā)、系統(tǒng)集成和工程示范。

　　2.建立符合科技創(chuàng)新規(guī)律的現(xiàn)代研究所制度，建立有利于重大科研成果產出與人才培養(yǎng)的管理機制，建立與區(qū)域創(chuàng)新體系各單元協(xié)同創(chuàng)新的有效方式，建立面向城市生態(tài)與環(huán)境科技發(fā)展的公共技術研發(fā)平臺，成為區(qū)域創(chuàng)新體系的有機組成部分，提升區(qū)域自主創(chuàng)新能力，帶動區(qū)域相關產業(yè)發(fā)展，培育新興產業(yè)。

　　3.結合重大科技任務引進優(yōu)秀人才，結合科技創(chuàng)新實踐培養(yǎng)學術人才，結合知識轉移與技術轉化向社會輸送技術人才，結合區(qū)域經濟社會發(fā)展需求培訓管理人才，成為城市環(huán)境與健康研究領域人才高地，成為區(qū)域創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)人才培養(yǎng)高地。

　　二、研究重點領域

　　1.城市生態(tài)健康與環(huán)境安全

　　(1)城市生態(tài)健康系統(tǒng)分析與監(jiān)測；(2)城市環(huán)境復合污染機理與效應；(3)城市環(huán)境安全風險評價與預警；(4)城市環(huán)境分析技術與方法。

　　2.城市環(huán)境污染控制與資源化技術 

　　(1)城市水污染控制與資源化技術；(2) 城市土壤污染修復技術；(3)城市大氣污染控制與資源化技術；(4)城市固體廢棄物污染控制與資源化技術；(5)高效環(huán)境材料制備技術；(6)環(huán)境生物技術。

　　3.城市環(huán)境工程與循環(huán)經濟

　　(1)城市環(huán)境污染控制工程與示范；(2)生態(tài)產業(yè)工程與示范；(3)城市生態(tài)環(huán)境技術集成與示范；(4)城市物質能量代謝與循環(huán)經濟建設模式示范。

　　4.城市生態(tài)環(huán)境規(guī)劃與管理

　　(1)城市環(huán)境與全球變化；(2)城市發(fā)展與城市安全；(3)城市智慧管理技術；(4)城市生態(tài)環(huán)境規(guī)劃理論與技術；(5)城市綠色低碳發(fā)展規(guī)劃理論與技術；(6)城市環(huán)境管理與政策。

　　三、公共平臺建設

　　科技部國際科技合作基地、國家級對臺科技合作與交流基地、福建省國際科技合作基地和國際科聯(lián)“城市健康計劃國際項目辦公室”；中國科學院城市環(huán)境與健康重點實驗室、中國科學院城市污染物轉化重點實驗室、中科院城市固體廢棄物資源化技術工程實驗室、中國科學院區(qū)域大氣環(huán)境研究卓越創(chuàng)新中心；福建省城市固體廢棄物資源化工程研究中心、福建省流域生態(tài)重點實驗室、廈門大氣環(huán)境福建省野外科學觀測研究站、浙江省城市環(huán)境過程與污染控制重點實驗室；廈門市城市代謝重點實驗室、廈門市水環(huán)境安全與水質保障工程技術研究中心、廈門市危險廢物鑒別和處置技術研發(fā)公共服務平臺、廈門市物理環(huán)境重點實驗室、廈門市室內空氣與健康重點實驗室、寧波市城市環(huán)境過程與污染控制重點實驗室。

　　四、對外合作

　　研究所已與美國、英國、德國、法國、日本、加拿大、澳大利亞、荷蘭、韓國等十多個國家及香港、臺灣的高水平研究機構保持著頻繁的交流和密切的合作關系，并與英國阿伯丁大學、美國佛羅里達大學、美國新澤西州立大學、香港理工大學等單位簽署了全面合作協(xié)議。

　　五、人員規(guī)模

　　研究所現(xiàn)有工作人員320人，碩、博士研究生440人。其中中國工程院院士1人、中國科學院院士1人，國家杰出青年基金獲得者5人、科技部中青年科技創(chuàng)新領軍人才3人、國家青年科技獎獲得者2人。

　　六、觀測研究站

　　根據(jù)“一所兩站”的戰(zhàn)略布局，研究所首個研究站——中國科學院城市環(huán)境研究所寧波觀測研究站在寧波市北侖區(qū)建立并投入使用。寧波站依托所本所，立足寧波市，輻射長三角，面向國家城市化發(fā)展過程中的生態(tài)環(huán)境保護等重大戰(zhàn)略需求，面向國際城市生態(tài)科學和環(huán)境科學與技術的發(fā)展前沿，服務于區(qū)域經濟和社會可持續(xù)發(fā)展，開展城市環(huán)境長期觀測研究、城市生態(tài)環(huán)境與健康、城市環(huán)境治理與修復技術、環(huán)境治理工程與循環(huán)經濟、城市規(guī)劃與環(huán)境政策研究與開發(fā)以及技術轉移、轉化和規(guī)模產業(yè)化。