中心由中日兩國政府合作，于1996年5月5日建成投入使用。自成立以來，中心在環(huán)境政策研究、環(huán)境信息化建設、固體廢物管理、環(huán)境宣傳教育、環(huán)境分析測試、環(huán)境標準樣品研發(fā)與應用、環(huán)境技術交流合作、環(huán)境管理能力建設等方面為國家環(huán)境保護事業(yè)發(fā)展做出了積極貢獻。

中心的主要職責和業(yè)務領域包括新污染物、特征污染物、復雜樣品等環(huán)境樣品分析測試和典型區(qū)域流域等環(huán)境污染調查監(jiān)測和風險評估技術方法研究，社會化環(huán)境檢測機構質量監(jiān)督管理技術支持工作，生態(tài)環(huán)境損害鑒定評估技術方法研究和相關技術服務，生態(tài)環(huán)境科研成果評估、推廣和應用，重大科技專項管理，環(huán)境標準樣品研發(fā)與應用技術服務，環(huán)境社會風險防范和環(huán)境政策社會風險評估，生態(tài)環(huán)境大數(shù)據(jù)應用研究，農村生態(tài)環(huán)境治理技術體系研究，規(guī)劃環(huán)境影響評價研究，中國環(huán)境標志標識管理，促進綠色消費、低碳發(fā)展、工業(yè)生態(tài)設計研究與咨詢，排污權有償使用和交易監(jiān)督管理技術支持，污染源調查技術研究和數(shù)據(jù)管理與分析，人才隊伍建設和體制改革研究，中日環(huán)境合作交流與項目管理，國際國內環(huán)境交流與培訓，及相關技術交流與咨詢服務等。

中心擁有國家生態(tài)環(huán)境科技成果轉化綜合服務平臺、國家環(huán)境保護二噁英污染控制重點實驗室、國家環(huán)境保護污染物計量和標準樣品研究重點實驗室、中日環(huán)境合作示范基地，是中國環(huán)境科學學會環(huán)境社會治理專業(yè)委員會、可持續(xù)消費與生產專業(yè)委員會的依托單位。主辦《中國環(huán)境管理》期刊。

目前，中心正按照精準治污、科學治污、依法治污的工作方針和協(xié)同推進降碳、減污、擴綠、增長的總要求，聚焦主責主業(yè)、協(xié)同整合資源，為綠色低碳發(fā)展和支撐持續(xù)深入打好污染防治攻堅戰(zhàn)提供有力的管理支撐、有為的政策咨詢、有效的技術服務。